洋桔梗主要病害有莖枯病、根腐病、灰斑病等。

　　莖枯病系真菌侵染，主要危害植株莖部，發病時，洋桔梗莖部皮層組織腐爛。高溫高濕環境容易導致該病發生。發病初期噴施1%的波爾多液，嚴重時可用50%甲基托布津可濕性粉劑500倍液和50%百草清可濕性粉劑500～800倍液交替使用，每3～5天噴灑一次。另外注意加強通風透光;降低植株種植密度;合理施氮肥，適當增加磷鉀肥，提高植株抗病能力。

　　根腐病也是一種真菌病害，主要侵染根部及根莖部，發病時根莖部形成黑色壞死斑，嚴重時植株枯死。該真菌傳播主要靠土壤、肥料、澆水等。防治方法：施用腐熟的肥料;澆水適當，避免積水;發病初期可用50%的多菌靈可濕性粉劑600倍液，每隔10天左右噴施一次，連續2～3次。

　　灰斑病初期癥狀是葉面上形成無明顯邊緣的橢圓形至矩圓形灰色至淺褐色病斑，后期變為褐色。病斑多限于平行葉脈之間，大小4～20×2～5(mm)。濕度大時，病斑背面生出灰色霉狀物，即病菌分生孢子梗和分生孢子。強田間管理，雨后及時排水，防止濕氣滯留。發病初期噴灑75%百菌清可濕性粉劑500倍液或50%多菌靈可濕性粉劑600倍液、40%克瘟散乳油800～900倍液、50%苯菌靈可濕性粉劑1500倍液、25%苯菌靈乳油800倍液、20%三唑酮乳油1000倍液。